Kazım Karabekir MYO, Tıbbi Hizmetler ve Teknikler Bölümü, Makale Koleksiyonu
Bu koleksiyon için kalıcı URI
Güncel Gönderiler
Öğe Escherichia coli as a versatile cell factory: Advances and challenges in recombinant protein production(Academic Press Inc., 2024) İncir, İbrahim; Kaplan, ÖzlemE. coli plays a substantial role in recombinant protein production. Its importance increased with the discovery of recombinant DNA technology and the subsequent production of the first recombinant insulin in E. coli. E. coli is a widely used and cost-effective host to produce recombinant proteins. It is also noteworthy that a significant portion of the approved therapeutic proteins have been produced in this organism. Despite these advantages, it has some disadvantages, such as toxicity and lack of eukaryotic post-translational modifications that can lead to the production of misfolded, insoluble, or dysfunctional proteins. This study focused on the challenges and engineering approaches for improved expression and solubility in recombinant protein production in E. coli. In this context, solution strategies such as strain and vector selection, codon usage, mRNA stability, expression conditions, translocation to the periplasmic region and addition of fusion tags in E. coli were discussed.Öğe God, mind and authority in spinozian thought(Univ Federal Ceara, Geography Posgraduate Program, 2023) Pepe, Muhammet Mustafa; Uguz, Hülya EskiReligion has a relevant role in the framing of social life throughout human history. In all organized and non-organized societies, the influence of religion in the organization of the social life of the individual really great. In addition to the legal ties that bind people together in the society, religious ties are also important. In short, the statement The history of humanity is shaped by the profound influence of religion is a statement that should not be underestimated. This study is based on how Spinoza defines the concepts of God, mind and authority in his thought.Öğe A novel fluorescent sensor based on an enzyme-free system for highly selective and sensitive detection of glyphosate and malathion in real samples(Elsevier B.V., 2023) Aydın, Ziya; Keskinateş, Mukaddes; Akın, Şeyma; Keleş, Hülya; Keleş, MustafaMalathion (Mal) and glyphosate (Glyp) are widely used organophosphorus pesticides to prevent or control insects and weed in agriculture. Unfortunately, the extensive and frequent commercial use of these compounds on farmland has caused their presence as residues in crops and livestock. Therefore, the design of new sensors with enhanced analyte selectivity and sensitivity is critical in this field. Here, we developed an optical sensor for the detection of malathion and glyphosate. The sensor, N,N-dimethyl-4-(3-(pyrazin-2-ylimino)prop-1-en-1-yl)aniline (CNP), was synthesized in a one-step reaction by condensation of 4-(dimethylamino)cinnamaldehyde with 2-aminopyrazine. CNP gives a rapid color change, absorbance and fluorescence response to Glyp and Mal in the presence of the metal ions and pesticides tested in the working system. The binding stoichiometry between the sensor and the pesticides (Glyp and Mal) was investigated by some spectrophotometric methods and the sensing mechanisms were eludicated by NMR titration experiments, suggesting that CNP responds to Glyp via H-bonding and to Mal via the coordination. The sensor has a high selectivity and rapid response to the pesticides (Glyp and Mal) with low detection limits. The sensor was also successfully used to monitor the pesticides in real samples; Mal in apple and tap water samples, and Glyp in potato, tap water and soil samples.Öğe A rapid responsive coumarin-naphthalene derivative for the detection of cyanide ions in cell culture(Academic Press Inc., 2022) Aydın, Ziya; Keskinateş, Mukaddes; Yılmaz, Bahar; Durmaz, Mustafa; Bayrakçı, MevlütCyanide ion (CN−) is widely used in many industrial processes; however, it causes several diseases in humans. Therefore, rapid and accurate detection of CN− is very important and urgent. In this study, a CN− sensor (MH-2) which was capable of detecting CN− ions in living cell was developed. MH-2 gives a rapid color change, absorbance and fluorescence response to CN− in the presence of the anions tested in the working system. The binding ratio between the sensor and CN− was demonstrated by some spectrophotometric methods and the sensing mechanism was investigated by NMR titration experiments, suggesting that MH-2 gives response to CN− via the nucleophilic addition reaction. The fluorescence detection limit and the absorbance detection limit were calculated as 0.056 μM and 0.11 μM, respectively. Both of these detection limits are below the tolerable limit recommended by WHO for CN− in the drinking water (1.9 μM). MH-2 was also applied to living cells for bio-imaging and the results showed that the sensor penetrates the cells and can detect cyanide ions in living cells.Öğe Two novel enzyme-free colorimetric sensors for the detection of glyphosate in real samples(Academic Press Inc., 2022) Aydın, Ziya; Akın, Şeyma; Çenet, Esma Nur; Keskinateş, Mukaddes; Akbulut, Abdullah; Keleş, Hülya; Keleş, MustafaThe intensive use and accumulation of glyphosate cause many environmental and ecological problems. There is an urgent need for an effective detection method for glyphosate. Many studies in the literature determine glyphosate by an enzyme-based method, requiring appropriate temperature, pH, substrate and ionic strength. In this study, we presented a simple enzyme-free reaction system. Two new simple Schiff base derivatives, 4-(((3-chloropyridin-4-yl)imino)methyl)-N,N-dimethylaniline (BNP-Cl) and 4-((3-((3-chloropyridin-4-yl)imino)propenyl)-N,N-dimethylaniline (CNP-Cl), were prepared by combining a pyridine moiety with a cinnamaldehyde or a benzaldehyde moiety. The pyridine moiety contains a chlorine atom, and this chlorine atom is replaced by the nitrogen or oxygen of glyphosate (Glyp) in ACN/Tris buffer (pH=8.14, 10 mM, v/v 2:1). This binding caused color changes ranging from colorless to yellow for BNP-Cl and yellow to orange for CNP-Cl. The sensors BNP-Cl and CNP-Cl have a rapid and excellent selectivity for glyphosate with low detection limits (1.78 µM for BNP-Cl and 1.60 µM for CNP-Cl). The sensors were also successfully applied to detect Glyp in real samples such as soil, tap water, and potatoes.Öğe A highly selective optical sensor for the detection of cyanide ions in aqueous solution and living cells(Elsevier B.V., 2022) Yılmaz, Bahar; Keskinateş, Mukaddes; Aydın, Ziya; Bayrakçı, MevlütA fluorogenic naphthalene based receptor (NFS) has been successfully generated by preparation from 3-amino-2-naphthol and 2-hydroxy-1-naphthaldehyde, it was then characterized. Optical and colorimetric properties of the receptor (NFS) in terms of cyanide (CN-) ions were investigated by several methods including naked-eye detection, UV–vis spectrophotometry and fluorescence spectroscopy. A visual color change from yellow to orangish-pink was observed upon interaction of the receptor with cyanide (CN-) ions in solution, while no color change appeared upon addition of the other anions tested. The detection limit of NFS was calculated as 0.21 µM without any interaction with other anions tested which is lower than that described by the World Health Organization for CN– ions in drinking water. It can be concluded that the receptor (NFS) was sensitive and rapid enough for the detection of CN- ions in solutions. The interaction between the receptor and CN– ions was also investigated by 1H NMR titration, MALDI-Tof mass spectrometry, and FTIR-AR spectroscopy. NFS was also applied to the bio-imaging of human epithelial cell line (HEK 293) and the cell imaging studies demonstrated that the receptor was capable of detecting cyanide ions in living cells.Öğe The investigation of morphological, anatomical and ecological properties of endemic Silene anatolica and Silene lycaonica(2014) Şen, Hakan; Bağcı, Yavuz; Çıtak Yılmaz, BurcuBu çalışmada Caryophyllaceae familyasına ait endemik Silene anatolica Meltzheimer & A. Baytop ve Silene lycaonica Chowdh. türlerinin morfolojik, anatomik ve ekolojik özellikleri araştırıldı. Morfolojik çalışmalarda türlerin; gövde, yaprak, çiçek ve meyve kısımlarının ölçümleri yapıldı ve daha önce yapılan çalışmalardan farklılıkları tablo halinde verildi. Anatomik incelemelerde ise, her iki türün kök, gövde ve yapraklarından, mikrotom ve el ile kesitler alındı. Alınan bu kesitler boyandı ve daimi preparatlar haline getirildi. Daha sonra kameralı mikroskop yardımıyla bu preparatların fotoğrafları çekildi ve ayrıntılı anatomik incelemeler yapıldı. Türlerin yayılış alanlarından alınan toprak örnekleri analiz edildi.Öğe Halkla ilişkiler eğitiminde uluslararasılaşmanın önemi: İngiltere ve Türkiye üzerine karşılaştırmalı bir çalışma(2017) Solmaz, Başak; Taştekin, Halil; Yüksek, Öznur; Akpınar, Kadir; Bakmaz, Esra Yayİlk halkla ilişkiler derslerinin 1923 yılında ABD New York Üniversitesinde Edward Bernays tarafından verilmeye başlamasından itibaren günümüze kadar uzanan süreçte, başta ABD ve Batı Avrupa ülkeleri olmak üzere hizmet sektörünün geliştiği dünyanın hemen hemen her ülkesindeki üniversitelerde halkla ilişkiler lisans eğitiminin kendi başına müstakil bir bölüm/program olarak yer aldığı görülmektedir. Günümüzde ise küreselleşmenin de etkisiyle birlikte halka ilişkiler lisans eğitimi veren üniversitelerin ders müfredatlarının uluslararasılaşması bir zorunluluk haline gelmiştir. Bunun öncelikli nedeni halkla ilişkiler uygulayıcılarının söz konusu global iş çevresinde rekabet edebilmesi için donanımlarının/niteliklerinin zenginleştirilmesi ihtiyacıdır. Nitekim halkla ilişkiler uzmanlığının hedef kitlesini oluşturan kamular artık çok çeşitli ve geniş bir yelpazede varlık göstermektedir. Yalnızca uluslararası kurum ve kuruluşlar değil aynı zamanda küçük ve orta ölçekli organizasyonlar da farklı düzeylerde uluslararasılaşma kapsamında etkinliklerini sürdürmektedir. Bu bağlamda çalışmada, Avrupa modeli halkla ilişkiler eğitimi veren iki ülke olan İngiltere ve Türkiye'nin giriş standartları en yüksek 10'ar halka ilişkiler lisans bölümü tespit edilerek web sayfalarındaki ders müfredatları incelenmiş ve uluslararasılaşma oranları belirlenmiştir. Ders müfredatlarının incelenmesi neticesinde ortaya çıkan sonuca göre İngiltere'de Leeds Beckett Üniversitesi ve Türkiye'de Gazi Üniversitesi dışında diğer tüm üniversitelerin halkla ilişkiler lisans bölümlerinin ders müfredatlarındaki uluslararasılaşma oranının %10'un altında kaldığı görülmüştür. İngiltere'de Manchester Metropolitan Üniversitesi, Greenwich Üniversitesi, West London Üniversitesi ve Londra Sanat Üniversitesi olmak üzere dört üniversitede uluslararasılaşma anlamında hiçbir dersin bulunmayışı şaşırtıcı bir bilgi olarak karşımıza çıkmaktadır. Türkiye'de ise en düşük oran %1,79 olarak Anadolu Üniversitesi özelinde dikkat çekmekte, bu oranı 4,17 yüzdesi ile Adnan Menderes Üniversitesi takip etmektedir. Ortaya çıkan bu sonuç halkla ilişkiler ders müfredatlarındaki uluslararası içeriğe sahip ders sayısının üniversitelerin tercihlerine bırakılmayıp bir eğitim politikası olarak genele yayılmasının bir zorunluluk haline geldiğini göstermektedir. Bu noktada halkla ilişkiler eğitiminin uluslararasılaşması konusunda bir standardizasyona gidilebilmesi ve konuya ilişkin farkındalık oluşturulabilmesi için ciddi bir takım çalışmalar yapılması gerektiği anlaşılmaktadır. Yapılacak olan bu çalışmaların sürekli değişen küresel dengelere paralel olarak halkla ilişkiler sektörünün güncel ihtiyaçlarını karşılamak adına olumlu sonuçlar doğuracağını söylemek yanlış olmayacaktır
