Domuz jelatinine özgü DNA aptamerlerinin seçilimi ve karakterizasyonu

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0002-8049-7867en_US
dc.authorid0000-0003-0354-8832en_US
dc.contributor.authorBayraç, Abdullah Tahir
dc.contributor.authorKandemir, Berke Bilgenur
dc.date.accessioned2021-01-10T06:55:05Z
dc.date.available2021-01-10T06:55:05Z
dc.date.issued2018
dc.departmentKMÜ, Mühendislik Fakültesi, Biyomühendislik Bölümüen_US
dc.description.abstractAptamerler farklı hedeflere yüksek etkin ve özgünlükte bağlanabilen DNA ve RNA moleküllerdir. Bu çalışmada domuz jelatininin algılanmasında kullanılmak üzere DNA aptamerleri geliştirilmiştir. Aptamerlerin seçilimi için tekrarlı, negatif seçilim bulunan bir SELEX metodu takip edilmiş ve kütüphaneler bu yolla zenginleştirilmiştir. Zenginleştirilen kütüphaneler tarafımızca modifiye edilmiş bir metagenomik dizileme metodu kullanılarak yeni nesil dizileme sistemi Miseq ile dizilenmiş ve elde edilen yüksek hacimli veriden aday aptamer dizileri uygun biyoinformatik araçlar kullanılarak belirlenmiştir. Floresan modifiye olarak üretilen aday DNA aptameri domuz jelatinine karşı yüksek afinite göstermekte balık ve sığır jelatinine görece düşük afinite ile bağlanmaktadır. Bu çalışmada geliştirilen aptamer gıda tağşişlerinin belirlenmesi için kullanılacak sensörlerin geliştirilmesinde potansiyel algılama ajanı olarak kullanılabilecektir.en_US
dc.description.abstractAptamers are DNA or RNA molecules that can bind to their target in high affinity and specificity. In this study we developed DNA aptamers to use in the detection of porcine gelatine. Selection of aptamers was performed by repetitive SELEX procedure with negative selection and libraries are enriched by this method. Enriched libraries were sequenced by a new generation sequencing system Miseq using a modified metagenomics method and bioinformatics tools were used to identify candidate aptamers from high throughput data. Florescence modified DNA aptamer showed high affinity to porcine gelatine, and low affinity to fish and bovine gelatine. Aptamer generated in this study has potential use in the detection of adulteration in food as sensing agent.en_US
dc.identifier.citationBayraç, A. T., Kandemir, B. B. (2018). Domuz jelatinine özgü DNA aptamerlerinin seçilimi ve karakterizasyonu. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 2, 22, 774-778.
dc.identifier.doi10.19113/sdufbed.88900
dc.identifier.endpage778en_US
dc.identifier.issn1300-7688
dc.identifier.issn1308-6529
dc.identifier.issue2en_US
dc.identifier.startpage774en_US
dc.identifier.trdizinid379747
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.19113/sdufbed.88900
dc.identifier.urihttps://app.trdizin.gov.tr/makale/TXpjNU56UTNOdz09
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11492/4090
dc.identifier.volume22en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.institutionauthorBayraç, Abdullah Tahir
dc.institutionauthorKandemir, Berke Bilgenur
dc.language.isotr
dc.relation.journalSüleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.titleDomuz jelatinine özgü DNA aptamerlerinin seçilimi ve karakterizasyonuen_US
dc.title.alternativeSelection and characterization of porcine gelatine specific DNA aptamersen_US
dc.typeArticle

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Bayraç, Abdullah Tahir.pdf
Boyut:
988.92 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin /Full Text
İndir

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Mühendislik Fakültesi, Biyomühendislik Bölümü, Makale Koleksiyonu